Gestion des niveaux d'eau
La restauration de l'habitat du phragmite aquatique passe par une maîtrise des niveaux d'eau, permettant des inondations hivernales et des étiages estivaux, tout en conservant en août et septembre au moment du passage des oiseaux, des mares peu profondes et des prairies faiblement inondées par 1 à 20 cm d'eau.

Trois sites, trois problématiques différentes
Sur Rosconnec : les marais sont parcourus par d'anciens fossés de drainage de 100 m de long sur 1 à 2 m de large et de profondeur, qui interdisent toute inondation temporaire et limitent le nombre et la taille des mares.
Trois problématiques, trois solutions adaptées
Deux plus tard, les ceintures de végétation hélophyte basse se mettent progressivement en place autour des 24 mares, sur une surface totale de 0,7 hectare.
Sur Trunvel
La tranchée est longue d'environ 75 m, profonde et large de 2 m. Son emplacement coïncide avec un accès facile à l'étang et une dynamique géomorphologique du cordon dunaire qui est modérée à cette endroit de la baie. Ainsi, la brèche s'ensable de nouveau chaque été et automne, ce qui garantit la protection des marais arrière-dunaires contre une intrusion excessive de la mer, sans qu'il soit nécessaire t'intervenir trop souvent pour désensabler.
Sur Pen Mané
Le creusement d'un fossé d'un kilomètre de long sur 4 m de large et 1 m de profondeur améliore la circulation de l'eau et assure la tranquillité du marais vis à vis de la divagation des chiens.
En 2008 et 2009, l'étiage a été contrôlé et limité aux mois d'août et septembre, tout en conservant des secteurs inondés (mares et nouveau fossé).
La figure ci-dessous schématise l'ensemble des travaux hydrauliques sur le marais de Pen Mané.

Principes d'aménagements
Plusieurs principes ont guidé ces aménagements hydrauliques :